Shiatsu is inzetbaar voor een diversiteit aan klachten. Een klacht is een signaal van een blokkade. Vaak zijn er meerdere klachten aanwezig. Vanuit de Chinese geneeskunde wordt gezocht naar de oorzaak van de klacht/signaal.

Een klacht kan fysiek zijn:
- pijn in de pezen bij het hardlopen.
- zeurende pijn in de onderrug.
- zuurbrandenen/of boeren.
- winderigheid.

Een combinatie van klachten is mogelijk:
- pijn in onderrug, pijn in knieën en vaak koude voeten.
- moeilijk in slaap komen, bewust van hart kloppen en blijven 'malen' in het hoofd
- snel geïrriteerd, heb vaak hoofdpijn, en spanning in de schouders.

Soms ontbreekt een duidelijke fysieke klacht
- druk in het hoofd.
- opgejaagd voelen, geen rust vinden en moe zijn
      
Acuut of chronisch:
Bij chronische klachten kan Shiatsu verlichting brengen. Soms is een klacht niet te verhelpen maar kan de rest van het lichaam wel sterker gemaakt worden zodat de klacht minder 'impact' heeft op het dagelijkse leven.